MicrosoftWindowsAzure云平台上实施创新的医学搜索工具

在Supercomputing 2010大会上，Microsoft发布了一系列高性能计算(HPC)公告，其中包括在Microsoft Windows Azure云平台上实施创新的医学搜索工具。在11月13日至19日运行的Supercomputing 2010中，微软宣布在Windows Azure上发布了生物技术信息中心基本本地比对搜索工具，也称为NCBI BLAST。新的应用程序使更广泛的科学家社区能够将桌面资源与云计算的功能相结合，从而进行生物学研究。在会议上，Microsoft在Windows Azure上展示了该应用程序的巨大规模，展示了它在NCBI管理的数据库中用于蛋白质序列的1000亿比较的用途。

基于Windows Azure的NCBI BLAST构建于Windows Azure之上，使研究人员能够利用Windows Azure平台的可伸缩性来对云中的大量蛋白质组学和基因组数据进行分析。BLAST是一套程序，旨在搜索所有可用的序列数据库，以查找蛋白质或DNA查询与已知序列之间的相似性。BLAST允许快速匹配近距离序列关系和远距离序列关系，从而提供分数，使用户能够以高度统计准确度将真实匹配与背景匹配区分开。

微软表示，Windows Azure上的BLAST通过允许研究人员在Windows Azure云平台上租用处理时间，扩展了BLAST程序套件的功能。该公司表示，这些程序在云上的可用性允许实验室甚至个人拥有大量的计算资源，而每次运行的成本却非常低。对于无法访问大型计算机资源的研究人员，这极大地增加了分析数据的选项。他们现在可以进行更复杂的分析或尝试以前根本不可行的其他方法。

微软服务器和工具业务总裁鲍勃·穆利亚(Bob Muglia)在一份声明中说：“ Windows Azure上的NCBI BLAST为所有研究组织提供了传统上只有大型实验室才能负担得起的相同计算资源。” “它展示了Windows Azure如何提供真正的平台即服务功能，技术计算应用程序需要此功能才能从海量数据中提取见解，以帮助解决科学，商业和政府领域的一些全球最大挑战。”

生物信息学，能源，药物研究和许多其他领域的研究人员使用BLAST筛选大型数据库，以帮助识别新的动物物种，提高药物效力和生产生物燃料以及用于其他目的。Windows Azure上的NCBI BLAST提供了用户友好的Web界面，并可以访问Windows Azure云计算，以进行非常大的BLAST计算以及较小规模的操作。该应用程序将使科学家能够使用其私人数据收集以及Windows Azure上托管的数据，并与之进行协作，包括NCBI公共蛋白质数据收集以及微软大蛋白质比较的结果。

Microsoft免费提供了Windows Azure软件上的NCBI BLAST，并且Microsoft的全球云研究参与计划对许多研究人员免费提供Windows Azure资源。有关更多信息，请访问http://research.microsoft.com/azure。

领导微软技术计算小组的HPC总经理Kyril Faenov在接受eWEEK采访时说：“我们希望大量生物信息学研究人员可以利用这一优势。”

Faenov说，西雅图儿童医院的研究人员能够使用Windows Azure上的NCBI BLAST在一周内解决六年的问题。根据西雅图儿童医院的一项Microsoft Research文章，对蛋白质相互作用感兴趣的研究人员希望更多地了解已知蛋白质序列的相互关系。由于已知蛋白质的数量庞大(将近1000万)，即使对于最先进的计算机，这也将是一个非常棘手的问题。当研究人员首次与Microsoft极限计算小组(XCG)接触时，看看Windows Azure上的NCBI BLAST是否可以帮助解决此问题，初步估计表明，单台计算机要花费六年以上的时间才能找到结果。但是通过利用云的功能，他们可以大大减少计算时间。

Windows Azure上的BLAST使研究人员能够将数百万个蛋白质序列分成多个组，然后将它们分发到多个(横跨两个大洲)的数据中心进行分析。通过使用云，研究人员在大约一周内获得了结果。微软表示，这是迄今为止在Windows Azure上运行的最大的研究项目。

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